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No.365 研究課題 / Project

多摩川河口域の微生物資源、希少放線菌の多様性保全および新種の分離に向けた取り組みAttempt to conserve the diversity of rare actinomycetes and isolate the novel species of rare actinomycetes as the microbial resource in the Tama River estuary

学術研究
Academic Research
No.365
代表研究者
Principal Investigator
寺原 猛
Takeshi TERAHARA
所属(採択当時)
Affiliation
東京海洋大学
Tokyo University of Marine Science and Technology
研究内容要約
Research Summary
多摩川河口域と東京湾にて、サンプリングを行った。
採取した堆積物からDNAを抽出し、16S rRNA遺伝子のV3-V4領域を対象として細菌叢を解析した。放線菌は、細菌叢の数%程度であった。
低GC・超小型サイズの海洋放線菌Actinomarinalesの存在が多摩川河口域と東京湾で示唆され、多摩川河口域の希少放線菌に関する新たな知見が得られた。
また、様々な条件で希少放線菌の分離を試みた結果、新種の分離には至らなかったが、種々の希少放線菌(Micrococcus属、Micromonospora属、Rhodococcus属、およびVerrucosispora属)が分離された。

Samplings were performed in the Tama River estuary and Tokyo Bay.
Bacterial communities were analyzed from extracted DNA of the sediment samples based on V3-V4 region of the 16S rRNA gene.
Actinobacteria accounted for a few percent of the bacterial community.
The findings indicate that low GC and very small marine actinobacteria Actinomarinales exist at the sediment samples in the Tama River estuary and Tokyo Bay.
Under various conditions, novel species was not isolated, but various rare actinomycetes (Genus MicrococcusMicromonosporaRhodococcus, and Verrucosispora) were isolated.
共同研究者
Collaborators
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